撤回論文:新型コロナウイルスにHIVウイルスが組み込まれていた

Uncanny similarity of unique inserts in the 2019-nCoV spike protein to HIV-1 gp120 and Gag(2020, Pradhan)

最も近いウイルスであるSARS CoVと比較して、新型コロナウイルスのスパイク糖タンパク質(S)に2019-nCoVに特有で他のコロナウイルスには存在しない4つの挿入を発見しました。重要なのは、4つの挿入物すべてのアミノ酸残基が、HIV-1 gp120またはHIV-1 Gagのアミノ酸残基と同一性または類似性を持っていることです。興味深いことに、挿入物は一次アミノ酸配列上で不連続であるにもかかわらず、2019-nCoVの3Dモデリングでは、それらが収束して受容体結合部位を構成することが示唆されています。2019-nCoVに4つの固有の挿入物が見つかり、そのすべてがHIV-1の主要構造タンパク質のアミノ酸残基と同一性/類似性を持っていることは、偶然の産物である可能性は低いです。

スパイクタンパク質は、ウイルスが宿主細胞を識別してそれに付着し、ウイルスを組み立てるために重要です。(Beniac et al.、2006)

注目すべきは、4 つの挿入物はすべて pI 値が約 10 であり、ウイルスと宿主の相互作用を促進する可能性があることです。総合すると、この研究結果は、2019-nCoV の非伝統的な進化を示唆しており、さらなる調査が必要です。

ウイルスのアミノ酸配列を基にpI値を計算することで、ウイルスがどのようなpH環境で安定しやすいか、または免疫系に対してどのような反応を引き起こすかを予測できます。pI値が10ということは、そのウイルスの構造蛋白質がアルカリ性の環境で電荷がゼロになることを示しており、ウイルスの安定性や免疫応答への影響、さらには感染性においても重要な役割を果たす可能性があります。